TY - JOUR
TI - Rare SLC13A1 variants associate with intervertebral disc disorder highlighting role of sulfate in disc pathology
AU - Bjornsdottir, G.
AU - Stefansdottir, L.
AU - Thorleifsson, G.
AU - Sulem, P.
AU - Norland, K.
AU - Ferkingstad, E.
AU - Oddsson, A.
AU - Zink, F.
AU - Lund, S.H.
AU - Nawaz, M.S.
AU - Bragi Walters, G.
AU - Skuladottir, A.T.
AU - Gudjonsson, S.A.
AU - Einarsson, G.
AU - Halldorsson, G.H.
AU - Bjarnadottir, V.
AU - Sveinbjornsson, G.
AU - Helgadottir, A.
AU - Styrkarsdottir, U.
AU - Gudmundsson, L.J.
AU - Pedersen, O.B.
AU - Hansen, T.F.
AU - Werge, T.
AU - Banasik, K.
AU - Troelsen, A.
AU - Skou, S.T.
AU - Thørner, L.W.
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AU - Nielsen, K.R.
AU - Mikkelsen, S.
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AU - Jemec, G.
AU - Jennum, P.
AU - Johansson, P.I.
AU - Nielsen, K.R.
AU - Nyegaard, M.
AU - Bruun, M.T.
AU - Pedersen, O.B.
AU - Dinh, K.M.
AU - Sørensen, E.
AU - Ostrowski, S.
AU - Johansson, P.I.
AU - Gudbjartsson, D.
AU - Stefánsson, H.
AU - Þorsteinsdóttir, U.
AU - Larsen, M.A.H.
AU - Didriksen, M.
AU - Sækmose, S.
AU - Zeggini, E.
AU - Hatzikotoulas, K.
AU - Southam, L.
AU - Gilly, A.
AU - Barysenka, A.
AU - van Meurs, J.B.J.
AU - Boer, C.G.
AU - Uitterlinden, A.G.
AU - Styrkársdóttir, U.
AU - Stefánsdóttir, L.
AU - Jonsson, H.
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AU - Esko, T.
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AU - Teder-Laving, M.
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AU - Terao, C.
AU - Takuwa, H.
AU - Meulenbelt, I.
AU - Coutinho de Almeida, R.
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AU - Slagboom, P.E.
AU - Nelissen, R.R.G.H.H.
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AU - Babis, G.C.
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AU - Wu, T.T.
AU - Samartzis, D.
AU - Cheung, J.P.Y.
AU - Sham, P.C.
AU - Kraft, P.
AU - Kang, J.H.
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AU - Thomas, L.F.
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AU - Zhang, Y.
AU - Lietman, S.A.
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AU - Hartley, A.
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AU - Zheng, J.
AU - Wilkinson, J.M.
AU - Steinberg, J.
AU - Morris, A.P.
AU - Jonsdottir, I.
AU - Bjornsson, A.
AU - Olafsson, I.H.
AU - Ulfarsson, E.
AU - Blondal, J.
AU - Vikingsson, A.
AU - Brunak, S.
AU - Ostrowski, S.R.
AU - Ullum, H.
AU - Thorsteinsdottir, U.
AU - Stefansson, H.
AU - Gudbjartsson, D.F.
AU - Thorgeirsson, T.E.
AU - Stefansson, K.
AU - DBDS Genetic Consortium
AU - GO Consortium
JO - Nature Communications
PY - 2022
VL - 13
TODO - 1
SP - null
PB - Institute of Geographic Sciences and Natural Resources Research
SN - 2041-1723
TODO - 10.1038/s41467-022-28167-1
TODO - disability;  gene;  gene expression;  pathology;  serum;  sulfate, cotransporter;  SLC13A1 protein, human;  sodium sulfate;  sulfate, 3' untranslated region;  bone;  genetics;  genome-wide association study;  human;  intervertebral disk;  intervertebral disk degeneration;  intervertebral disk hernia;  metabolism, 3' Untranslated Regions;  Bone and Bones;  Genome-Wide Association Study;  Humans;  Intervertebral Disc;  Intervertebral Disc Degeneration;  Intervertebral Disc Displacement;  Sodium Sulfate Cotransporter;  Sulfates;  Symporters
TODO - Back pain is a common and debilitating disorder with largely unknown underlying biology. Here we report a genome-wide association study of back pain using diagnoses assigned in clinical practice; dorsalgia (119,100 cases, 909,847 controls) and intervertebral disc disorder (IDD) (58,854 cases, 922,958 controls). We identify 41 variants at 33 loci. The most significant association (ORIDD = 0.92, P = 1.6 × 10−39; ORdorsalgia = 0.92, P = 7.2 × 10−15) is with a 3’UTR variant (rs1871452-T) in CHST3, encoding a sulfotransferase enzyme expressed in intervertebral discs. The largest effects on IDD are conferred by rare (MAF = 0.07 − 0.32%) loss-of-function (LoF) variants in SLC13A1, encoding a sodium-sulfate co-transporter (LoF burden OR = 1.44, P = 3.1 × 10−11); variants that also associate with reduced serum sulfate. Genes implicated by this study are involved in cartilage and bone biology, as well as neurological and inflammatory processes. © 2022, The Author(s).
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