Διιδρυματικό ΠΜΣ Τεχνολογίες Πληροφορικής στην Ιατρική και τη Βιολογία
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών

2011-11-29

2011

Ουζούνογλου Ελευθέριος

Ηλίας Μανωλάκος Αναπλ. Καθηγ. Επιβλέπων

Εφαρμογή μεθόδων Συστημικής Βιολογίας για την κατανόηση του ρόλου της α-συνουκλεΐνης στην παθογένεση της νόσου του Πάρκινσον

Ελληνικά

Η Συστημική Βιολογία, έχει ως κύριο στόχο την δημιουργία υπολογιστικών μοντέλων
που επιτρέπουν την μελέτη της δυναμικής συμπεριφοράς των βιολογικών συστημάτων.
Τα τελευταία χρόνια, έχουν παρουσιαστεί σημαντικά ευρήματα σχετικά με τους
μοριακούς μηχανισμούς που εμπλέκονται στην ανάπτυξη της Νόσου του Πάρκινσον, με
τα κυριότερα να αφορούν στην εύρεση της συμμετοχής της πρωτεΐνης α-συνουκλεΐνης
και στις συνέπειες της μετάλλαξης ή της υπερ-έκφρασής της. Στα πλαίσια της
παρούσας διπλωματικής εργασίας, επιχειρήθηκαν τα πρώτα βήματα για την
δημιουργία ενός μοντέλου Συστημικής Βιολογίας, ικανού να προσομοιώνει τα
σχετικά με την υπερ-έκφραση της α-συνουκλεΐνης δυναμικά φαινόμενα και
ειδικότερα αυτά του ολιγομερισμού, της αποδόμησής από τους διάφορους
πρωτεολυτικούς μηχανισμούς του κυττάρου αλλά και την καταπίεση αυτών λόγω της
παθογενούς συμπεριφοράς της. Το μοντέλο, εκπαιδεύτηκε με τη χρήση εργαστηριακών
δεδομένων και προσομοιώνει ιδιαίτερα ικανοποιητικά τα παρατηρούμενα φαινόμενα.
ενώ προβλέπει και την δυναμική συμπεριφορά του βιολογικού συστήματος όταν σε
αυτό έχουν γίνει διάφορες εργαστηριακές παρεμβάσεις, παρότι δεν είχε προηγηθεί
καμία εκπαίδευση των παραμέτρων του σχετικά με αυτές τις περιπτώσεις. Τα
αποτελέσματα αυτά αποτελούν θετικές ενδείξεις όσον αφορά την ορθότητα και
ικανότητα προβλέψεων του μοντέλου αλλά και την δυνατότητα επέκτασης του, με
τελικό στόχο την συνδρομή στις αναζητήσεις των μηχανισμών ανάπτυξης της Νόσου
του Πάρκινσον.

Νόσος του Πάρκινσον, α-συνουκλεΐνη, Δίκτυα βιοχημικών αντιδράσεων, Μοντελοποίηση, in silico πειράματα

Ναι

7

Ναι

130

194

https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/1317498/file.pdf

https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/1317498