Φυλοδυναμική εκτίμηση κρίσιμων επιδημιολογικών παραμέτρων σε δίκτυα μεταδιδόμενης HIV-1 αντοχής σε μη θεραπευμένους οροθετικούς στην Ελλάδα με Μπεϋζιανή συμπερασματολογία

Διπλωματική Εργασία uoadl:2758916 409 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Διατμηματικό ΠΜΣ Βιοστατιστική και Επιστήμη Δεδομένων Υγείας
Βιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2018-05-18
Έτος εκπόνησης:
2018
Συγγραφέας:
Πανοπούλου Ιωάννα
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Δ. Παρασκευής, Επ. ΚΑθηγητής, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Ε. Σαμόλη, Επ. Καθηγήτρια, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Γ. Μαγιορκίνης, Λέκτορας, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Πρωτότυπος Τίτλος:
Φυλοδυναμική εκτίμηση κρίσιμων επιδημιολογικών παραμέτρων σε δίκτυα μεταδιδόμενης HIV-1 αντοχής σε μη θεραπευμένους οροθετικούς στην Ελλάδα με Μπεϋζιανή συμπερασματολογία
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Φυλοδυναμική εκτίμηση κρίσιμων επιδημιολογικών παραμέτρων σε δίκτυα μεταδιδόμενης HIV-1 αντοχής σε μη θεραπευμένους οροθετικούς στην Ελλάδα με Μπεϋζιανή συμπερασματολογία
Περίληψη:
Εισαγωγή: Η λοίμωξη με τον ιό της ανθρώπινης ανοσοανεπάρκειας (Human immunodeficiency virus - HIV) αντιμετωπίζεται με τη χορήγηση συνδυαστικών αντιρετροϊκών φαρμάκων. Η παρουσία αντοχής σε αντιρετροϊκά φάρμακα σε HIV(+) που δεν έχουν λάβει θεραπεία αυξάνει την πιθανότητα ιολογικής αποτυχίας σε πρωτοθεραπευμένους ασθενείς. Στην Ελλάδα οι μεταλλαγές αντοχής με τον υψηλότερο επιπολασμό σε μη θεραπευμένους HIV(+) είναι οι Κ103Ν, Ε138Α, και Ε138Q, που προσδίδουν αντοχή σε μη-νουκλεοσιδικά ανάλογα (NNRTIs). Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι τα στελέχη υπότυπου Α με μεταλλαγές αντοχής E138A και Κ103Ν παρουσιάζουν διασπορά σε τοπικό επίπεδο.

Σκοπός: Η διερεύνηση της δυναμικής της μετάδοσης των υπότυπων Α και Β σε στελέχη με ή χωρίς μεταλλαγές αντοχής.

Υλικό: Μελετήθηκαν αλληλουχίες υπότυπου Α και Β που είχαν απομονωθεί από HIV(+) που δεν είχαν λάβει θεραπεία το χρονικό διάστημα 01/01/2003-30/06/2015 στην Ελλάδα. Η ανάλυση πραγματοποιήθηκε σε τυχαία επιλεγμένα υποσύνολα αλληλουχιών για κάθε υπότυπο: i) πέντε υποσύνολα στα οποία δεν είχε γίνει καμία επιλογή αναφορικά με την παρουσία μεταλλαγών αντοχής (δείγμα Α), ii) πέντε υποσύνολα με παρουσία μεταλλαγών αντοχής (δείγμα Β), και iii) πέντε υποσύνολα στα οποία είχαν εξαιρεθεί οι πιο συχνές μεταλλαγές αντοχής (E138AQ και K103N) (δείγμα Γ).

Μέθοδοι: Η εκτίμηση της δυναμικής της μετάδοσης των υπότυπων Α και Β πραγματοποιήθηκε με φυλοδυναμική ανάλυση, η οποία βασίστηκε σε μεθόδους Μπεϋζιανής Συμπερασματολογίας και συγκεκριμένα σε μοντέλα γέννησης - θανάτου (BDM), στο πρόγραμμα BEAST v1.8.0.
Αποτελέσματα: Η φυλοδυναμική ανάλυση έδειξε ότι δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στον ρυθμό μετάδοσης του υπότυπου Α και Β στο συνολικό δείγμα (δείγμα Α). Αντίθετα για τα στελέχη με αντοχή (δείγμα Β) παρατηρήθηκε σημαντική μείωση του ρυθμού μετάδοσης του υπότυπου Β (διάμεση τιμή: 2,9) σε σύγκριση με τον υπότυπο Α (διάμεση τιμή: 5,2) το χρονικό διάστημα 2002-2008. Έχοντας εξαιρέσει τις πιο συχνές μεταλλαγές αντοχής (δείγμα Γ) βρέθηκε ότι ο ρυθμός μετάδοσης του υπότυπου Α ήταν 5,5 την περίοδο 2002-2008 και διέφερε σημαντικά από το ρυθμό του υπότυπου Β που ήταν 2,2 το ίδιο χρονικό διάστημα.

Συμπεράσματα: Η δυναμική της επιδημίας του υπότυπου Α και του υπότυπου Β ήταν παρόμοιες στο σύνολο του πληθυσμού των HIV(+). Αντίθετα, η δυναμική του υπότυπου Α ήταν υψηλότερη σε σχέση με του Β για τους ιούς που ταυτοποιήθηκαν με μεταλλαγές αντοχής. Τα παραπάνω υποδεικνύουν ότι τα ανθεκτικά στελέχη του υπότυπου Α έχουν μεταδοθεί πιο αποτελεσματικά
από εκείνα του Β, εύρημα το οποίο εξηγεί και τον υψηλότερο επιπολασμό τους.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
Φυλοδυναμική, Αντοχή, Οροθετικός, Μπεϋζιανή
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
76
Αριθμός σελίδων:
65
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.

Panopoulou Ioanna Master.pdf
1 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.