Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Γεώργιος Λυρίτης, Ομότιμος Καθηγητής, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Ισμήνη- Νίκη Δοντά, Καθηγήτρια, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Ιωάννης Τριανταφυλλόπουλος, Επίκουρος Καθηγητής, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Περίληψη:
Στην παρούσα μελέτη, συγκεντρώθηκαν γονιδιακά δεδομένα μικροσυστοιχιών από τη βάση δεδομένων GEO Database NCBBI, πειραμάτων που έγιναν σε στρωματικά κύτταρα, προ-οστεοβλάστες, οστεοβλάστες, οστεοκύτταρα και πρόδρομα κύτταρα της σειράς των μακροφάγων, σε βαρυτικά πεδία 0, 1 & 2g. Τα δεδομένα προέκυψαν από μελέτες επίγειες ή και στο διάστημα, διαφορετικής χρονικής διάρκειας, με τη χρήση διαφορετικών συσκευών προσομοίωσης. Η βιοπληροφορική ανάλυση ανέδειξε σημαντική σχέση μεταξύ των στατιστικά σημαντικών γονιδίων που εκφράζονταν στα στρωματικά κύτταρα που εκτέθηκαν σε μικροβαρύτητα για 192 ώρες και οστεοκυττάρων για 48ώρες. Επιπλέον τα οστεοκύτταρα εμφάνισαν κοινή γονιδιακή έκφραση στα διαφορετικά βαρυτικά πεδία, ανεξάρτητα από άλλους παράγοντες. Η γονιδιακή έκφραση όλων των κυτταρικών τύπων σε 0,1 & 2g κινούνταν πάνω σε ένα επίπεδο, υποδεικνύοντας πως μπορεί να υπάρχει εν τέλει μια ομάδα ρυθμιστικών γονιδίων κοινή για όλους τους τύπους. Τα στατιστικώς σημαντικά εκφραζόμενα γονίδια όταν αναλύθηκαν για τη συμμετοχή τους σε μεταβολικές οδούς, φάνηκε πως ανήκαν στη οδό μεταβολισμού πουρινών, τρυπτοφάνης, MAPK, τοξοπλάσμωσης, καρκινογένεσης, διαφοροποίησης οστεοκλαστών, ενεργοποίησης κυτοκινών, νευρωνικής επικοινωνίας και του ανοσοποιητικού συστήματος. Τα γονίδια που κωδικοποιούν τον Tnfrs1a(Tumor necrosis factor receptor member 1), Il1r1(Interleukin 1 receptor type 1), MAPK9(mitogen-activated protein kinase 9), MAP2K7(mitogen-activated protein kinase 7) παρουσιάζονται σε περισσότερα από δύο μεταβολικά μονοπάτια που ξεχωρίσαμε από την ανάλυση μας. Πρόκειται για οδούς που συμμετέχουν στην διαφοροποίηση οστεοκλαστών, σε διεργασίες φλεγμονής και ενεργοποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος και συγκεκριμένα της IgE διαμεσολαβούμενης απάντησης, προκαλώντας ενεργοποίηση του συμπλόκου μεταγραφικών παραγόντων NF-kB και κατά συνέπεια άμεσα ή έμμεσα δια οδών φλεγμονής, την ενεργοποίηση των οστεοκλαστών.
Λέξεις-κλειδιά:
Μικροβαρύτητα, Οστεοβλάστες, Γονιδιακή έκφραση, Οστεοκύτταρα
