Μονάδα:
Διατμηματικό ΠΜΣ Βιοστατιστική και Επιστήμη Δεδομένων ΥγείαςΒιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2018-12-17
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Δημήτριος Παρασκευής, Επίκουρος Καθηγητής, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Βασιλική-Αναστασία Σύψα, Επίκουρη Καθηγήτρια, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Γκίκας Μαγιορκίνης, Λέκτορας, Ιατρική, ΕΚΠΑ
Πρωτότυπος Τίτλος:
Μελέτη διασποράς των ΗΙV-1 ανασυνδυασμένων στελεχών (Β/G και B/F) στην Ισπανία με μεθόδους μοριακής επιδημιολογίας
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Μελέτη διασποράς των ΗΙV-1 ανασυνδυασμένων στελεχών (Β/G και B/F) στην Ισπανία με μεθόδους μοριακής επιδημιολογίας
Περίληψη:
Εισαγωγή: Προηγούμενη ανάλυση μας σε δείγμα 6.632 HIV-1 αλληλουχιών από Ισπανία έδειξε ότι τα ανασυνδυασμένα στελέχη B/G και B/F ήταν μεταξύ των μη-Β HIV-1 υπότυπων με υψηλό επιπολασμό στη Ισπανία.
Σκοπός: Η διερεύνηση του τρόπου διασποράς των B/G και B/F στην Ισπανία και η εκτίμηση του χρόνου προέλευσης και της δυναμικής των μεγαλύτερων τοπικών επιδημιών, χρησιμοποιώντας μεθόδους μοριακής επιδημιολογίας.
Υλικό: Μελετήθηκαν 102 αλληλουχίες B/G και 98 B/F με δειγματοληψία το διάστημα 2002-2014 σε 10 περιοχές της Ισπανίας.
Μέθοδος: Η φυλογενετική ανάλυση των υπο μελέτη αλληλουχιών πραγματοποιήθηκε μαζί με τις πιο όμοιες προς αυτές γενετικά αλληλουχίες ως αλληλουχίες αναφοράς. Ως τοπικά δίκτυα μετάδοσης (local transmission networks, LTNs) ορίστηκαν οι φυλογενετικές ομάδες με ποσοστό αλληλουχιών από Ισπανία >70%. Η φυλοδυναμική ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας μεθόδους Μπεϋζιανής συμπερασματολογίας.
Αποτελέσματα: Οι B/G και B/F βρέθηκαν σε υψηλότερα ποσοστά στη Ναβάρρα (B/G:7,4%; B/F:14,8%) και στη Χώρα των Βάσκων (B/G:4,9%; B/F:4,9%). Η φυλογενετική ανάλυση έδειξε ότι το 86,3% (N=88) των αλληλουχιών B/G από Ισπανία βρέθηκε εντός 9 LTNs. Τα δυο μεγαλύτερα από αυτά αποτελούνταν από 40 (39,2%; CRF14_BG) και 18 (17,6%; CRF20_BG) αλληλουχίες. Το 94,4% (N=17) των αλληλουχιών του CRF20_BG LTN βρέθηκε ότι είχε απομονωθεί στη Μαδρίτη από άνδρες που έκαναν σεξ με άνδρες (MSM), ενώ η γεωγραφική του προέλευση ήταν πιθανότατα από την Κούβα. Το 74,5% (N=73) των αλληλουχιών B/F από Ισπανία βρέθηκε εντός 9 LTNs. Το μεγαλύτερο εξ’ αυτών (CRF47_BF) αποτελούνταν από 32 (32,7%) αλληλουχίες, με το 78,1% (N=25) των αλληλουχιών να έχει απομονωθεί από ετεροφυλόφιλους. Ο εκτιμώμενος χρόνος προέλευσης (tMRCA) ήταν το 1991 (διάμεση τιμή) για τον CRF14_BG, το 2004 για τον CRF20_BG και το 2004 για τον CRF47_BF. Ο αριθμός των μεταδόσεων για τα LTNs των CRF47_BF και CRF20_BG εκτιμήθηκε ότι αυξήθηκε μεταξύ 2005 και 2011. Για τον CRF14_BG η μεγαλύτερη αύξηση στις μεταδόσεις συνέβη το διάστημα 1996-2005.
Συμπεράσματα: Η μελέτη ανέδειξε την ύπαρξη σημαντικής τοπικής διασποράς για τα ανασυνδυασμένα στελέχη B/G και B/F στην Ισπανία. Το επίκεντρο για τον B/G (CRF20_BG) βρέθηκε στη Μαδρίτη, και προήλθε πιθανότατα από την Κούβα. Οι πιο πρόσφατες τοπικές επιδημίες των CRF47_BF και CRF20_BG παρουσίασαν αύξηση στις μεταδόσεις για περίπου 6 έτη, ενώ η αύξηση της επιδημίας του CRF14_BG διήρκησε μεγαλύτερο χρονικό διάστημα.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
Μοριακή επιδημιολογία, Ανασυνδυασμένα στελέχη, Φυλογενετική, Φυλοδυναμική
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
63
