1. Ανάλυση βιολογικών επιδράσεων και θεραπευτικών ιδιοτήτων της κουρκουμίνης (curcumin) μέσω ανάλυσης μικροσυστοιχιών RNA και μετανάλυσης

2. Κατασκευή αλγορίθμου πρόγνωσης καναλιών ιόντων που ελέγχονται από προσδέτες

3. Χρήση του φυτού Arabidopsis Thaliana ως μοντέλο για την απόκριση σε βλάβες DNA, έπειτα από έκθεση σε Ιοντίζουσα Ακτινοβολία, με χρήση δεδομένων μικροσυστοιχιών.

4. Βελτιστοποίηση παραμέτρων αλγορίθμων κατηγοριοποίησης βιολογικών δεδομένων

5. «Επιλεκτικοί αναστολείς της ογκοπρωτεΐνης BRAFV600E μέσω ανάλυσης χημικής ομοιότητας, in silico μελέτες πρόσδεσης και in vitro έλεγχο»

6. Αξιοποίηση ομικών δεδομένων με σκοπό τη μελέτη και την ερμηνεία διαφορετικών αναπαραστάσεων ολοκληρωμένων δικτύων (Ιntegrated Networks)

7. Υπολογιστικές Μελέτες Μετα-μεταφραστικών Τροποποιήσεων Διαμεμβρανικών Πρωτεΐνών

8. Συγκριτική αξιολόγηση αλγορίθμων ομαδοποίησης εφαρμοσμένοι σε βιολογικά δίκτυα

9. Βιοπληροφορική ανάλυση της οικογένειας των πρωτεινών HU

10. Φυλογενετική ανάλυση αταβιστικών γονιδίων που σχετίζονται με διάφορες μορφές καρκίνου.

11. Μεταγονιδιωματική ανάλυση σε ιστούς ασθενών με μεταστατικό καρκίνο

12. Βιοπληροφορικές προσεγγίσεις περί της αποσαφήνισης της καρκινογένεσης με την διαμεσολάβηση των long non-coding RNAs

13. Ανάπτυξη αλγοριθμικής ροής για την συνθετική ανάλυση RNA – seq δεδομένων, με εφαρμογή στην διερεύνηση του γενετικού υποβάθρου εμφάνισης Μεταβολικού Συνδρόμου

14. Ανάλυση δικτύου αλληλεπιδράσεων πρωτεϊνών που σχετίζονται με αυτοάνοσα νοσήματα με μεθόδους βιοπληροφορικής

15. Βελτιστοποίηση διαλυτότητας θεραπευτικών μονοκλωνικών αντισωμάτων με υπολογιστικές μεθόδους

16. Χρήση μεθόδων μοριακής μοντελοποίησης για την βελτιστοποίηση νέων συνθετικών νευροστεροειδών με αγωνιστική δράση στους υποδοχείς νευροτροφινών

17. Ανάλυση αποτελεσμάτων Omics με στόχο τον προσδιορισμό βιοδεικτών

18. Εντοπισμός και συσχέτιση μικρών RNA (microRNA) σε ζωικό και ανθρώπινο γονιδίωμα με την απορρύθμιση βιολογικών διεργασιών (ασθένειες)

19. Μελέτη σχέσης κυτταρικής επικοινωνίας και ανοσίας

20. In sillico μελέτες αναστολέων της μεταλλαγμένης ογκοπρωτεΐνης BRAFV600E