Ανίχνευση πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων σε ολόκληρα προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά γονιδιώματα με χρήση μεθόδων ανάλυσης συγχωνευμένων πρωτεϊνικών δομικών ενοτήτων.

Διπλωματική Εργασία uoadl:1310064 349 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Διατμηματικό / Διϊδρυτικό ΠΜΣ Μοριακή Ιατρική
Βιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2012-10-04
Έτος εκπόνησης:
2012
Συγγραφέας:
Τρίμπαλης Φίλιππος
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Καθ. Νικόλαος Ανάγνου, Ερευνήτρια Α΄ Βλάχου, Ερευνήτρια Γ΄ Σοφία Κοσσίδα
Πρωτότυπος Τίτλος:
Ανίχνευση πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων σε ολόκληρα προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά γονιδιώματα με χρήση μεθόδων ανάλυσης συγχωνευμένων πρωτεϊνικών δομικών ενοτήτων.
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Περίληψη:
Στην παρούσα εργασία, εφαρμόστηκε η ανάλυση συγχώνευσης γονιδίων με συγκριτική
ανάλυση 19 οργανισμών από όλο το φάσμα του δέντρου της ζωής, με το Trypanosoma
brucei, ένα πρωτόζωο, το οποίο προκαλεί την Αφρικανική Τρυπανοσωμίαση ή
ασθένεια του ύπνου στους ανθρώπους, η οποία σε ορισμένες περιπτώσεις μπορεί να
είναι θανατηφόρα, ενώ τα διαθέσιμα φάρμακα στις μέρες μας έχουν πολλές και
σοβαρές παρενέργειες. Ο σκοπός της ανάλυσης ήταν να εντοπιστούν πρωτεϊνικές
αλληλεπιδράσεις οι οποίες να μπορούν να προσεγγιστούν φαρμακολογικά, με την
ανάπτυξη σκευασμάτων τα οποία να μπορούν να αναιρέσουν μια ζωτικής σημασίας για
το πρωτόζωο αλληλεπίδραση. Εντοπίστηκαν συνολικά 49 πιθανές πρωτεϊνικές
αλληλεπιδράσεις και έγινε η προσπάθεια να αξιολογηθούν ακόμα και προτεινόμενες
αλληλεπιδράσεις που να αφορούσαν υποθετικές πρωτεΐνες, για τις οποίες προτάθηκε
και μια πιθανή λειτουργία ή συμμετοχή σε βιολογικό μονοπάτι. Η μελέτη αυτή είχε
ως αποτέλεσμα να παράγει γνώση για περαιτέρω ανάλυση και εκτίμηση από την
επιστημονική κοινότητα, των προτεινομενων πρωτεϊνικών αλληλεπιδράσεων, με
παράλληλη ανάπτυξη της συνεργασίας με τομείς όπως η Δομική Βιολογία και η
μοντελοποίηση των πρωτεϊνών, αλλά και η κινητοποίηση ερευνητών για πειραματική
επιβεβαίωση. Τέλος, εκτιμήθηκε η σημαντικότητα της συγκεκριμένης τεχνικής και
έγινε σύγκριση με άλλες αντίστοιχες τεχνικές, ενώ η ανάλυση της εξελικτικής
μοίρας των πρωτεϊνών που συμμετείχαν στα γεγονότα συγχώνευσης έδειξε ότι τα
γονιδιακά αυτά συμβάντα (συγχώνευση/ διάσπαση) συμβαίνουν σε όλους τους
οργανισμούς χωρίς εξαιρέσεις, με άλλες να είναι συχνότερα και άλλα όχι τόσο
συχνά. Επίσης εντοπίστηκαν πολλαπλά και ιδιαίτερα πολύπλοκα γεγονότα τα οποία
παρουσιάζουν ιδιαίτερο εξελικτικό ενδιαφέρον το κάθε ένα ξεχωριστά.
Λέξεις-κλειδιά:
Γεγονότα συγχώνευσης γονιδίων, Τρυπανόσωμα, Πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις, Μέθοδος Rosetta Stone, Συγκριτική γονιδιωματική
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
56
Αριθμός σελίδων:
74
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.

document.pdf
3 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.