Μονάδα:
ΠΜΣ με ειδίκευση ΣΥΝΘΕΤΙΚΗ ΦΑΡΜΑΚΕΥΤΙΚΗ ΧΗΜΕΙΑΒιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2012-03-28
Συγγραφέας:
Ελευθεράτος Αριστοτέλης
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Αναπλ. Καθηγητής Αντώνιος Κολοκούρης (επιβλέπων), Καθηγητής Γεώργιος Φώσκολος, Καθηγητής Παναγιώτης Μαράκος
Πρωτότυπος Τίτλος:
Συνθεση του 25-πεπτιδίου της διαμεμβρανικής περιοχής της πρωτεΐνης Μ2 του ιού της γρίππης Α μέτρηση σταθερών σύνδεσης αμινοαδαμαντανικών παραγώγων με ισοθερμική θερμιδομετρία τιτλοδότησης και υπολογισμοί πρόσδεσης
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Περίληψη:
Μελετήθηκε η αλληλεπίδραση αμινοαδαμαντανικών φαρμάκων με τον δίαυλο πρωτονίων
της πρωτεΐνης Μ2 του ιού influenza A μέσω της πραγματοποίησης υπολογισμών
πρόσδεσης μιας σειράς αμινοαδαμαντανικών προσδετών 1-31 που συντέθηκαν στο
παρελθόν και μετρήθηκε η συγγένεια σύνδεσης. Μετρήθηκε η συγγένεια σύνδεσης
έναντι: α) Ολόκληρης της πρωτεΐνης Μ2 χρησιμοποιώντας μέθοδο που βασίζεται στην
αναστολή της απόσβεσης του φθορισμού της Trp41 β) Του τετραμερούς Μ2ΤΜ σε
αλκαλικό pH χρησιμοποιώντας ισοθερμική θερμιδομετρία τιτλοδότησης. To
25-πεπτίδιο M2TM/Udorn συντέθηκε με πεπτιδική σύνθεση σε στερεά φάση.
Πραγματοποιήθηκαν τρεις σειρές υπολογισμών πρόσδεσης χρησιμοποιώντας το
λογισμικό Gold και τις συναρτήσεις βαθμολογίας που υποστηρίζει (Goldscore,
Chemscore, ASP). Αποδείχθηκε ότι πρέπει να συμπεριληφθούν μόρια νερού εντός του
πόρου στους υπολογισμούς πρόσδεσης ώστε να προβλεφθεί ο πειραματικός
προσανατολισμός της αμινομάδας προς τη μεριά της His37 του C-τελικού άκρου. Ο
προσανατολισμός αυτός σταθεροποιείται μέσω της παρεμβολής μορίων νερού που
σχηματίζουν ένα δίκτυο δεσμών-Η μεταξύ αμινομάδας προσδέτη και His37. Οι
υπολογισμοί πρόσδεσης προβλέπουν προσανατολισμούς στους οποίους το αδαμαντάνιο
περιβάλλεται από αλκυλικές πλευρικές αλυσίδες των αμινοξέων Val27 και Ala30.
Βρέθηκε υψηλή συσχέτιση μεταξύ των σταθερών σύνδεσης που προσδιορίστηκαν με
φυσικοχημικά πειράματα και των σκορ που υπολογίστηκαν με συμβατικές συναρτήσεις
βαθμολογίας χρησιμοποιώντας το πρότυπο φραγμού του πόρου του ιοντικού δίαυλου
και μόρια νερού εντός του πόρου.
Λέξεις-κλειδιά:
Ισοθερμική θερμιδομετρία τιτλοδότησης, Πεπτιδική σύνθεση, Ιός της γρίππης Α, Αμινοαδαμαντάνια, Υπολογισμοί πρόσδεσης
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
x-xiii
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
33
Αριθμός σελίδων:
ΧΙΙΙ, 153
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο.
document.pdf
2 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο.
