Μονάδα:
Κατεύθυνση Εφαρμογές της Βιολογίας στην ΙατρικήΒιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2017-03-07
Συγγραφέας:
Στύλιος Ιωάννης
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
ΚΟΛΛΙΑ ΠΑΝΑΓΟΥΛΑ, ΑΝΑΠΛΗΡΩΤΡΙΑ ΚΑΘΗΓΗΤΡΙΑ ΜΟΡΙΑΚΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΑΝΘΡΩΠΟΥ, ΤΜΗΜΑ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ, Ε.Κ.Π.Α.
Πρωτότυπος Τίτλος:
«Διερεύνηση των υπεύθυνων μεταλλαγών που σχετίζονται με γενετικά νοσήματα μέσω της μελέτης του γονιδιώματος με νέες τεχνολογίες υψηλής απόδοσης: ανάλυση μεταλλαγών/πολυμορφισμών σε νέα γονίδια και συσχέτιση με κλινικοεργαστηριακά ευρήματα»
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
«Διερεύνηση των υπεύθυνων μεταλλαγών που σχετίζονται με γενετικά νοσήματα μέσω της μελέτης του γονιδιώματος με νέες τεχνολογίες υψηλής απόδοσης: ανάλυση μεταλλαγών/πολυμορφισμών σε νέα γονίδια και συσχέτιση με κλινικοεργαστηριακά ευρήματα»
Περίληψη:
Η παρούσα διπλωματική εργασία πραγματεύεται την μοριακή διερεύνηση μονογονιδιακών νοσημάτων και ιδιαιτέρως ενός μονογονιδιακού νοσήματος, της Κυστικής Ίνωσης, με την τεχνολογία αλληλούχισης DNA νέας γενιάς (NGS: Next Generation Sequencing). Η Κυστική Ίνωση είναι μια κληρονομική πολυσυστηματική νόσος, αυτοσωμικού υπολειμματικού χαρακτήρος, η οποία θεωρείται ως το σημαντικότερο κληρονομικό νόσημα στη λευκή φυλή. Στην Ελλάδα γεννιούνται με Κυστική Ίνωση συνολικά 50-60 παιδιά το χρόνο (1 παιδί ανά εβδομάδα περίπου). Το 4-5% του γενικού πληθυσμού, θεωρείται ότι είναι φορέας του παθολογικού γονιδίου και η συχνότερη γονιδιακή μετάλλαξη που παρατηρείται στον Eλλαδικό χώρο είναι η F508del ή ΔF508, η οποία θεωρείται από τις βαρύτερες σε συμπτωματολογία μεταλλάξεις.
Η χρήση της τεχνολογίας NGS μέσω της πλατφόρμας αλληλούχισης Ion Torrent PGM, οδήγησε στην αλληλούχιση του γονιδίου CFTR σε 692 εξεταζόμενους και ανιχνεύθηκαν 158 ευρήματα εκ των οποίων σε 155 βρέθηκαν 60 μεταλλαγές και 26 αποτελούν ευρήματα που χαρακτηρίζονται ως VOUS (Variant Of Unknown Significance). Μια in silico προσέγγιση των νέων ευρημάτων μας οδήγησε στον χαρακτηρισμό 4 εξ’ αυτών ως παθολογικά. Πραγματοποιήθηκαν, επίσης, πειράματα προσομοίωσης του ελεύθερου εμβρυϊκού DNA στο πλάσμα εγκυμονούσης σε ποσοστά 10%, 6% και 3% με σκοπό την διερεύνηση των δυνατοτήτων του sequencer, τα οποία και ανιχνεύτηκαν, αποτελώντας ένα από τα πρώτα βήματα για ανάπτυξη in-house NIPD.
Η νόσος της Κυστικής Ίνωσης και εν γένει τα γενετικά νοσήματα αποκτούν μια άλλη διάσταση στην αναφερόμενη ως NGS-era. Το NGS αναδεικνύεται ως ένα πολύτιμο εργαλείο που έχει να προσφέρει και η σωστή αξιοποίηση του θα αλλάξει την εικόνα της μελλοντικής ιατρικής γενετικής.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
γονίδιο, γενετικό νόσημα, μονογονιδιακή νόσος, κυστική ίνωση, πολυμορφισμός, μετάλλαξη, τεχνολογία υψηλής απόδοσης, δευτέρας γενιάς αλληλούχιση, NGS, ελεύθερο εμβρυϊκό DNA, προσομοίωση, κλινικόεργαστηριακά ευρήματα,βιοηθική
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
2
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
140
