Ανάπτυξη αλγοριθμικής ροής για την συνθετική ανάλυση RNA – seq δεδομένων, με εφαρμογή στην διερεύνηση του γενετικού υποβάθρου εμφάνισης Μεταβολικού Συνδρόμου

Διπλωματική Εργασία uoadl:2779462 177 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Κατεύθυνση Βιοπληροφορική
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2018-08-01
Έτος εκπόνησης:
2018
Συγγραφέας:
Φωτάκης Γεώργιος
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Κωνσταντίνος Βοργιάς, Καθηγητής, Τομέας Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας, Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Χατζηιωάννου Αριστοτέλης, Ερευνητής Β, Ινστιτούτο Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας , Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών
Γεωργακίλας Αλέξανδρος, Τομέας Φυσικής, Επίκουρος Καθηγητής, Σχολή Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών, Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο
Πρωτότυπος Τίτλος:
Ανάπτυξη αλγοριθμικής ροής για την συνθετική ανάλυση RNA – seq δεδομένων, με εφαρμογή στην διερεύνηση του γενετικού υποβάθρου εμφάνισης Μεταβολικού Συνδρόμου
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Ανάπτυξη αλγοριθμικής ροής για την συνθετική ανάλυση RNA – seq δεδομένων, με εφαρμογή στην διερεύνηση του γενετικού υποβάθρου εμφάνισης Μεταβολικού Συνδρόμου
Περίληψη:
Στόχος της παρούσας διπλωματικής εργασίας είναι η ανάπτυξη μιας αυτοματοποιημένης και αναπαραγώγιμης αλγοριθμικής ροής, η οποία θα χρησιμοποιηθεί για την ανάλυση σύνθετων χαρακτηριστικών με την αξιοποίηση του γενετικού πάνελ αναφοράς Collaborative Cross (CC) (GRP) ποντικιών, τόσο σε μεταγραφικό όσο και σε γονιδιακό επίπεδο. Η αναλυτική αλγοριθμική ροή εφαρμόστηκε για να εκτιμηθεί το γενετικό υπόβαθρο εμφάνισης ευαισθησίας του οργανισμού στην παχυσαρκία καθώς και να διερευνηθούν οι βασικοί παθοφυσιολογικοί μηχανισμοί που οδηγούν στην εμφάνιση αντίστασης στην δράση της ινσουλίνης. Η ινσουλινοαντίσταση φαίνεται να είναι ο συνδετικός κρίκος μεταξύ παχυσαρκίας και Μεταβολικού Συνδρόμου καθώς και Σακχαρώδη Διαβήτη τύπου 2.
Η έκφραση των ηπατικών γονιδίων διαφέρει σημαντικά μεταξύ των παχύσαρκων και μη παχύσαρκων ποντικιών, με το φύλο να διαδραματίζει σημαντικό ρόλο, καθώς φαίνεται ότι τα αρσενικά και θηλυκά ποντίκια παρουσιάζουν διαφορετικούς μηχανισμούς τόσο εκδήλωσης όσο και απόκρισης στην εμφάνιση παχυσαρκίας και Μεταβολικού Συνδρόμου.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λοιπές θεματικές κατηγορίες:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
ντοκερ, αλγοριθμική ροή, μεταβολικό σύνδρομο, παχυσαρκία, αλληλούχιση RNA
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
86
Αριθμός σελίδων:
131

Fotakis_Thesis.pdf
3 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.