Μονάδα:
Κατεύθυνση Μοριακή Βιοϊατρική - Μηχανισμοί Ασθενειών, Μοριακές και Κυτταρικές θεραπείες και ΒιοκαινοτομίαΒιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2021-10-11
Συγγραφέας:
Ιωαννίδου Ελισάβετ
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Ελένη Ντούνη, Καθηγήτρια, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Τριάς Θηραίου, Επίκουρη Καθηγήτρια, Τμήμα Βιοτεχνολογίας, Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Παντελής Χατζής, Ερευνητής Β’, Ε.ΚΕ.Β.Ε. “Αλέξανδρος Φλέμιγκ”
Πρωτότυπος Τίτλος:
Analysis of the transcriptome in modelled osteoporosis
Γλώσσες εργασίας:
Αγγλικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Ανάλυση του μεταγραφώματος σε μοντέλο οστεοπόρωσης
Περίληψη:
Η οστεοπόρωση είναι μια πολυπαραγοντική νόσος που χαρακτηρίζεται από οστική απώλεια, ευθραυστότητα των οστών και αυξημένο κίνδυνο καταγμάτων. Αναφέρεται συχνά ως μια σιωπηλή επιδημία αφού συχνά δε διαγιγνώσκεται μέχρι να υπάρξει κάποιο κάταγμα. Το εργαστήριό μας έχει εγκαθιδρύσει ένα γενετικό μοντέλο ποντικού για την οστεοπόρωση μέσω υπερέκφρασης της ανθρώπινης πρωτεΐνης RANKL (TgRANKL). Προκειμένου να ταυτοποιήσουμε διαφορικά εκφραζόμενα (ΔΕ) γονίδια με πιθανή κλινική σημασία στην οστεοπόρωση, διεξαγάγαμε αλληλούχηση RNA (RNA-Seq) για mRNA και miRNA σε καθαρισμένα από μυελό των οστών μηριαία οστά TgRANKL ποντικών. Σχετικά με τα mRNAs, ταυτοποιήσαμε συνολικά 2.747 ΔΕ γονίδια (|log2FoldChange| > 1, adjusted p-value < 0.05), 959 εκ των οποίων ήταν αυξορρυθμιζoμένα και 1.788 μειωρρυθμιζόμενα στα TgRANKL μηριαία οστά σε σχέση με τα αγρίου τύπου. Ανάλυση εμπλουτισμού στα αυξορρυθμιζoμένα γονίδια αποκάλυψε ότι σχετίζονταν με την αποικοδόμηση των πρωτεϊνών, τη ενεργότητα της πεπτιδάσης, την απόκριση στις κυτταροκίνες, την απορρόφηση μετάλλων και την αναδιαμόρφωση των οστών, ενώ τα μειορρυθμιζόμενα γονίδια σχετίζονταν κυρίως με την οξειδωτική φωσφορυλίωση, το μεταβολισμό, ποικίλες οδούς σηματοδότησης, την οργάνωση του κυτταροσκελετού και το μυϊκό σύστημα. Μέσω RT-qPCR επιβεβαιώθηκαν 10 από τα αυξορρυθμιζoμένα γονίδια και 3 μειωρρυθμιζόμενα. Όσον αφορά τα miRNAs, εντοπίσαμε 63 ΔΕ miRNAs (|log2FoldChange| > 1, adjusted p-value < 0.05), με 33 από αυτά είναι αυξορρυθμιζoμένα και 30 μειωρρυθμιζόμενα. Μέσω RT-qPCR επιβεβαιώθηκαν 3 αυξορρυθμιζoμένα και 3 μειωρρυθμιζόμενα. Συμπερασματικά, τα ΔΕ γονίδια που ταυτοποιήθηκαν και επιβεβαιώθηκαν σε αυτή τη μελέτη μπορεί να χρησιμεύσουν ως βάση για την ανακάλυψη νέων ρυθμιστικών μηχανισμών και νέων βιοδεικτών στην οστεοπόρωση.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
RANKL, Οστεοπόρωση, RNA-Seq, Βιοδείκτες, Διαγονιδιακά ποντίκια
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
156
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-10-11.
Ioannidou_Εlisavet_Master.pdf
3 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-10-11.
