Assessment of the toxicity of xenobiotics in aquatic organisms through targeted and un-targeted metabolomics analysis, by the use of high-resolution mass spectrometry techniques

Διδακτορική Διατριβή uoadl:3228555 51 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Τμήμα Χημείας
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2022-07-28
Έτος εκπόνησης:
2022
Συγγραφέας:
Δαμάλας Δημήτριος
Στοιχεία επταμελούς επιτροπής:
1. Δρ. Αντώνιος Καλοκαιρινός, Καθηγητής (Ομότιμος), Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
2. Δρ. Νικόλαος Σ. Θωμαΐδης, Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
3. Δρ. Δημήτρης Μπέης, Ερευνητής Β, ΙΙΒΕΑΑ
4. Δρ. Ευάγγελος Γκίκας, Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
5. Δρ. Ευάγγελος Μπακέας, Αναπληρωτής Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
6. Δρ. Αναστάσιος Οικονόμου, Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
7. Δρ. Χρήστος Κόκκινος, Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Χημείας, ΕΚΠΑ
Πρωτότυπος Τίτλος:
Assessment of the toxicity of xenobiotics in aquatic organisms through targeted and un-targeted metabolomics analysis, by the use of high-resolution mass spectrometry techniques
Γλώσσες διατριβής:
Αγγλικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Μελέτη της τοξικότητας ξενοβιοτικών ενώσεων σε υδρόβιους οργανισμούς μέσω στοχευόμενης και μη στοχευόμενης μεταβολομικής ανάλυσης με τεχνικές φασματομετρίας μάζας υψηλής διακριτικής ικανότητας
Περίληψη:
Δεδομένου του μεγάλου αριθμού αναδυόμενων ρύπων (ΑΡ) στο περιβάλλον , υπάρχει ένα σημαντικό κενό στη βιβλιογραφία σχετικά με τις δυσμενείς επιπτώσεις τους στους υδρόβιους οργανισμούς. Ο αντίκτυπος των ξενοβιοτικών ενώσεων στο υδάτινο οικοσύστημα αξιολογείται σε μεγαλύτερο βάθος όταν μελετηθεί τόσο το ξενοβιοτικό μεταβόλωμα (ξενοβιοτικές ενώσεις και τα προϊόντα βιομετατροπής (ΠΒΜ) τους) όσο και το ενδο μεταβόλωμα (μεταβολίτες και λιπίδια) των υδρόβιων οργανισμών. Η μεγάλη πολυπλοκότητα των περιβαλλοντικών μητρών και ο τεράστιος αριθμός ξενοβιοτικών και ενδογενών χημικών ουσιών που δυνητικά υπάρχουν σε χαμηλές συγκεντρώσεις, αποτελούν μια αναλυτική πρόκληση. Ως εκ τούτου, η ανάπτυξη ισχυρών αναλυτικών μεθόδων που παρέχουν εκτεταμένα αναλυτικά στοιχεία είναι ζωτικής σημασίας. Εκτός από την αναλυτική πλατφόρμα που εφαρμόζεται, είναι επιβεβλημένη η δημιουργία περιεκτικών ροών επεξεργασίας δεδομένων που αξιοποιούν τα αναλυτικά στοιχεία στο μέγιστο.
Ο γενικός στόχος αυτής της διατριβής ήταν να αναδείξει μια ολιστική προσέγγιση που θα προσφέρει ολοκληρωμένη κάλυψη τόσο του ξενο-μεταβολώματος και ενδο-μεταβολώματος για να επιτευχθεί ολοκληρωμένη αξιολόγηση της τοξικότητας των υδρόβιων οργανισμών που εκτίθενται σε ξενοβιοτικές ενώσεις.
Σε αυτό το πλαίσιο, αναπτύχθηκε μια αναλυτική πλατφόρμα που βασίζεται σε τεχνικές τελευταίας τεχνολογίας (RPLC/HILIC-HRMS (Κεφάλαιο 3) και LC-TIMS-HRMS (Κεφάλαιο 4)) που συνδυάζει πολλαπλές διαστάσεις διαχωρισμού με φασματομετρία μάζας υψηλής διακριτικής ικανότητας, προκειμένου να παρέχει εκτεταμένα πειραματικά στοιχεία για την ταυτοποίηση ΠΒΜ και ενδογενών μεταβολιτών/λιπιδίων. Αναπτύχθηκε επίσης μια ροή εργασιών επεξεργασίας δεδομένων, αποτελούμενη από προσεγγίσεις σάρωσης ύποπτων ενώσεων και μη στοχευμένης σάρωσης, που συνδυάζει διαφορετικά εργαλεία ταυτοποίησης για την αναγνώριση της δομής των ΠΒΜ (Κεφάλαια 3 & 4). Επιπλέον, αναπτύχθηκαν ευρέως πεδίου εφαρμογής στοχευμένη και μη στοχευμένη προσέγγιση μεταβολομικής, αποτελούμενες από εξελιγμένα εργαλεία επεξεργασίας δεδομένων που μπορούν να αξιοποιήσουν δεδομένα 4-D (Κεφάλαιο 5).
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
ξενοβιοτικές ενώσεις; zebrafish; φασματομετρία μάζας υψηλής διακριτικής ικανότητας; φασματομετρία κινητικότητας παγιδευμένων ιόντων; ορθογώνια ταυτοποίηση; βιομεταροπή; σάρωση ύποπτων ενώσεων; μη στοχευμένη σάρωση; στοχευμένη μεταβολομική ευρέως πεδίου εφαρμογής; μη στοχευμένη μεταβολομική, τοξικο-μεταβολομική
Ευρετήριο:
Ναι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
5
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
199
Αριθμός σελίδων:
227
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2025-07-29.

PhD Thesis_D.E.Damalas_final.pdf
6 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2025-07-29.

 


Electronic Supplementary Material_D.E.Damalas_final.rar
6 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2025-07-29.