Ariel ένα long non coding RNA με πιθανό ρυθμιστικό ρόλο στη νευρογένεση

Διπλωματική Εργασία uoadl:1314673 352 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Διατμηματικό / Διϊδρυτικό ΠΜΣ Μοριακή Ιατρική
Βιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2012-09-10
Έτος εκπόνησης:
2012
Συγγραφέας:
Αντωνίου Δάφνη
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Αναπλ. Καθηγητής Ευθυμιόπουλος Σπύρος (επιβλέπων), Ερευνητής Χαρώνης Αρης, Ερευνητής Πολίτης Πάνος
Πρωτότυπος Τίτλος:
Ariel ένα long non coding RNA με πιθανό ρυθμιστικό ρόλο στη νευρογένεση
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Περίληψη:
Την τελευταία δεκαετία έχουν προκύψει πολλά πειραματικά δεδομένα, που δείχνουν
ότι περιοχές του DNA που δεν μεταφράζονται συμμετέχουν ενεργά στη ρύθμιση
πολλών και ποικίλων κυτταρικών διαδικασιών. Η αναλυτική μελέτη του
μεταγραφώματος (transcriptome) αποκάλυψε πληθώρα περιοχών που μεταγράφονται
αλλά δε σχετίζονται με τη δημιουργία πρωτεϊνών. Σε αυτή την κατηγορία ανήκουν
και τα long non coding RNAs τα οποία είναι μεταγραφόμενα RNA μόρια, μεγέθους
μεγαλύτερου από 200 νουκλεοτίδια. Οι λειτουργίες των lncRNAs έχουν μεγάλο
εύρος. Η έκφραση των lncRNAs μπορεί να επηρεάζει την έκφραση των γειτονικών
τους γονιδίων. Με βάση τις γνωστές πληροφορίες για το Prox1 και τη
σημαντικότητά του στην νευρωνική διαφοροποίηση θέλαμε να ερευνήσουμε εάν το
γονίδιο του Prox1 σχετίζεται με κάποιο lncRNA. Από λεπτομερή ανάλυση της
βιβλιογραφίας διαπιστώσαμε την ύπαρξη αναφορών για την παρουσία ενός lncRNA σε
στενή γειτνίαση με το γονίδιο του Prox1. Η βιοπληροφορική ανάλυση των
δημοσιευμένων μεταγράφων έδειξε ότι αυτό το υποθετικό lncRNA, το οποίο
ονομάστηκε από την ομάδα μας Ariel, εκφράζεται αντι-παράλληλα με το Prox1,
έχοντας συμπληρωματική αλληλουχία 134 βάσεων στο 5’ UTR (5’ αμετάφραστη
περιοχή). Στόχος της εργασίας μας ήταν η μελέτη του συγκεκριμένου lncRNA καθώς
και η πιθανή συσχέτιση του με το Prox1. Αρχικά δείξαμε ότι το Ariel εκφράζεται
έντονα στο αναπτυσσόμενο νευρικό σύστημα του ποντικού, και συγκεκριμένα
διαπιστώσαμε ότι εκφράζεται στα εμβρυϊκά στάδια που συμπίπτουν με την έναρξη
της αστρογλοιογένεσης. Επιπλέον, δείχνει υψηλά επίπεδα έκφρασης και στα νευρικά
βλαστικά κύτταρα (ΝΒΚ) που διαφοροποιούνται προς αστροκύτταρα. Αυτά τα δεδομένα
προτείνουν ότι το Ariel ίσως να εμπλέκεται στους μοριακούς μηχανισμούς
καθορισμού της ταυτότητας
των ΝΒΚ κατά την ανάπτυξη του νευρικού συστήματος. Για να ελέγξουμε αυτή την
υπόθεση πραγματοποιήσαμε πειράματα υπερέκφρασης του Ariel σε ΝΒΚ, τα οποία
απομονώνουμε από το εμβρυϊκό κεντρικό νευρικό σύστημα του ποντικού και
καλλιεργούμε in vitro. Έτσι δείξαμε ότι το Ariel είναι ικανό να επάγει την
αστρογλοιογένεση και να καταστέλλει τη
νευρογένεση. Επίσης δείξαμε ότι είναι ικανό να καταστέλλει την έκφραση του
Prox1 τόσο στο επίπεδο της πρωτεϊνης όσο και του mRNA. Γνωρίζοντας ότι το Prox1
δρα στα ΝΒΚ με τον αντίθετο τρόπο, δηλαδή καταστέλλει την αστρογλοιογένεση και
επάγει την νευρογένεση,Προτείνουμε ότι το Ariel μέσω της ικανότητάς του να
μειώνει την έκφραση Prox1 στο μεταγραφικό επίπεδο, ίσως να ρυθμίζει τη
διαφοροποίηση των ΝΒΚ κατά την ανάπτυξη του νευρικού συστήματος.
Λέξεις-κλειδιά:
Νευρογένεση, Αστροκύτταρα, Ανάπτυξη, Ανοσοφθορισμός, Βλαστοκύτταρα
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
76
Αριθμός σελίδων:
62