Μονάδα:
Κατεύθυνση ΒιοπληροφορικήΒιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2019-05-10
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Βασιλική Οικονομίδου, Επίκουρη Καθηγήτρια, Τομέας Βιολογίας Κυττάρου και Βιοφυσικής, Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο
Σταύρος Χαμόδρακας, Ομότιμος Καθηγητής, Τομέας Βιολογίας Κυττάρου και Βιοφυσικής, Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο
Ευαγγελία Χρυσίνα, Ερευνήτρια Β’, Ινστιτούτο Βιολογίας, Φαρμακευτικής Χημείας και Βιοτεχνολογίας, Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών
Πρωτότυπος Τίτλος:
Δημιουργία βάσης δεδομένων για ασθένειες που σχετίζονται με την εναπόθεση αμυλοειδών ινιδίων
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Δημιουργία βάσης δεδομένων για ασθένειες που σχετίζονται με την εναπόθεση αμυλοειδών ινιδίων
Περίληψη:
Τα αμυλοειδή ινίδια σχηματίζονται όταν διαλυτές πρωτεΐνες αυτοσυγκροτούνται σε αδιάλυτα, υψηλά οργανωμένα συσσωματώματα. Η εναπόθεση των ινιδίων αυτών σε ποικίλους ιστούς και όργανα οδηγεί στην εμφάνιση ενός συνόλου ασθενειών που ονομάζονται «αμυλοειδώσεις». Αξιοσημείωτο είναι το γεγονός ότι η εναπόθεση των αμυλοειδών ινιδίων έχει καταγραφεί σε πλήθος παθολογικών καταστάσεων, συμπεριλαμβανομένων γνωστών νευροεκφυλιστικών και ενδοκρινικών ασθενειών. Επιπρόσθετα, διάφορες αμυλοειδώσεις έχουν καταγραφεί ως σπάνιες επιπλοκές σε πολλές άλλες παθολογικές καταστάσεις.
Σε μία προσπάθεια να αποκτηθεί μία συνολική εικόνα για αυτές τις ασθένειες πραγματοποιήθηκε εκτεταμένη βιβλιογραφική αναζήτηση, με στόχο τη δημιουργία μίας ολοκληρωμένης συλλογής των κλινικών καταστάσεων που σχετίζονται με την εναπόθεση αμυλοειδών ινιδίων . Σε αυτή τη διπλωματική εργασία, παρουσιάζεται μία βάση δεδομένων για αμυλοειδώσεις και για ασθένειες που συσχετίζονται με αυτές, η οποία ονομάζεται AmyCo. Στην πρώτη της έκδοση περιέχει πληροφορίες για 75 ασθένειες, που χωρίζονται σε δύο μεγάλες κατηγορίες: Στην «Αμυλοειδώσεις» και στην «Κλινικές καταστάσεις που σχετίζονται με την εμφάνιση αμυλοείδωσης». Κάθε εγγραφή στη βάση έχει εμπλουτιστεί με δεδομένα που αφορούν την πρωτεΐνη που συσσωματώνεται, άλλα πρωτεϊνικά συστατικών αμυλοειδών εναποθέσεων (συν-εναποτεθειμένες πρωτεΐνες) και τους ιστούς ή τα όργανα που επηρεάζονται στην εκάστοτε ασθένεια. Ακόμη, οι εγγραφές της βάσης διαθέτουν εκτενή σχολιασμό και αναφορές στις ελεύθερα διαθέσιμες βάσεις δεδομένων ICD-10, MeSH, OMIM, PubMed, AmyPro και UniProtKB. Η AmyCo αποτελεί την πρώτη προσπάθεια ενοποίησης της ετερογενούς ομάδας των αμυλοειδώσεων σε μία σύγχρονη και καλά ενημερωμένη, ελεύθερα διαθέσιμη βάση δεδομένων.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
αμυλοειδή ινίδια, αμυλοείδωση, βάση δεδομένων, αμυλοειδείς εναποθέσεις
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
3
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
228
