Κατεύθυνση Βιοπληροφορική
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών

2019-11-03

2019

Καδδά Άννα

Αλέξανδρος Γεωργακίλας, Αναπληρωτής Καθηγητής, Τομέας Φυσικής, Σχολή Εφαρμοσμένων Μαθηματικών και Φυσικών Επιστημών, Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο
Χατζηιωάννου Αριστοτέλης, Ερευνητής, Ινστιτούτο Βιολογίας, Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών
Βοργιάς Κωνσταντίνος, Καθηγητής, Τμήματος Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών

Ανάλυση βιολογικών επιδράσεων και θεραπευτικών ιδιοτήτων της κουρκουμίνης (curcumin) μέσω ανάλυσης μικροσυστοιχιών RNA και μετανάλυσης

Ελληνικά

Ανάλυση βιολογικών επιδράσεων και θεραπευτικών ιδιοτήτων της κουρκουμίνης (curcumin) μέσω ανάλυσης μικροσυστοιχιών RNA και μετανάλυσης

Ο κουρκουμάς αποτελεί ένα μπαχαρικό το οποίο προέρχεται από το φυτό κουρκούμη ή κουρκουμά (turmeric ή με την επιστημονική ονομασία του Curcuma longa). Κυρίως χρησιμοποιείται στην ασιατική κουζίνα, καθώς και ως βαφή σε υφάσματα είτε σε τρόφιμα. Το βασικό ενεργό συστατικό του κουρκουμά είναι η κουρκουμίνη, η οποία έχει συσχετιστεί με αντιοξειδωτικές και αντιφλεγμονώδεις ιδιότητες, καθώς και να ασκήσει αντικαρκινικές επιδράσεις σε μία ποικιλία βιολογικών μονοπατιών που εμπλέκονται σε μετάσταση, ογκογένεση και απόπτωση. Εικάζεται πως βοηθάει στην πρόληψη και θεραπεία ασθενειών (όπως για παράδειγμα νόσος του Αλτσχάιμερ και διάφορες εκφυλιστικές παθήσεις) που σχετίζονται με την φλεγμονή και το οξειδωτικό στρες.
Στην παρούσα εργασία γίνεται προσπάθεια μελέτης φαινομένων απόκρισης των ηπατοκαρκινικών κυττάρων στην κουρκουμίνη. Πιο συγκεκριμένα μελετήσαμε:
• Αν οι ηπατοκυτταρικές καρκινικές σειρές ανταποκρίνονται στην κουρκουμίνη,
• Αν οι ηπατοκυτταρικές καρκινικές σειρές ανταποκρίνονται με κοινό τρόπο στην κουρκουμίνη,
• Με ποιους βιολογικούς μηχανισμούς ανταποκρίνονται οι ηπατοκυτταρικές καρκινικές σειρές στην κουρκουμίνη,
• Πως διαφέρει η μεταβολική απόκριση των ηπατοκυτταρικών καρκινικών σειρών χαρακτηρισμένοι ως sensitive με την μεταβολική απόκριση των resistant με παρουσία κουρκουμίνης,
• Αν αυτοί οι μηχανισμοί μπορούν να εξηγήσουν γιατί φαίνονται sensitive ή resistant σε περιβάλλον με παρουσία κουρκουμίνης.
Για τον σκοπό αυτό έγινε ανάλυση δεδομένων μικροσυστοιχιών με την χρήση της γλώσσας προγραμματισμού R καθώς και βιοπληροφορικών πακέτων και βιβλιοθηκών από τον Bioconductor. Επιπλέον για την λειτουργική ανάλυση έγινε χρήση βιοπληροφορικών εργαλείων ώστε να έχουμε αποτελέσματα που αφορούν σε βιολογικές λειτουργίες των φαινομένων απόκρισης στην κουρκουμίνη.
Τα αποτελέσματα που προέκυψαν φανέρωσαν μηχανισμούς που συσχετίζονται με γνωστή βιβλιογραφία και τις διαφορετικές αποκρίσεις των κυτταρικών σειρών του ήπατος παρουσία κουρκουμίνης.

Θετικές Επιστήμες

Μικροσυστοιχίες, ανάλυση έκφρασης γονιδίων, κουρκουμίνη, ηπατοκυτταρικές καρκινικές σειρές, λειτουργική ανάλυση

Ναι

3

Ναι

112

104

Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.

https://pergamos.lib.uoa.gr/uoa/dl/object/2884667