Ανάλυση του υποκινητή του γονιδίου VPNB1 σε διαγονιδιακές σειρές Arabidopsis thaliana κατά την βλαστική και αναπαραγωγική φάση ανάπτυξης των φυτών’

Πτυχιακή Εργασία uoadl:2962553 61 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Τμήμα Βιολογίας
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2021-10-24
Έτος εκπόνησης:
2021
Συγγραφέας:
Θεοδώρου Μαρία
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Κοσμάς Χαραλαμπίδης, Αναπληρωτής Καθηγητής Μοριακής Βιολογίας Ανάπτυξης Φυτών, Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ)
Πρωτότυπος Τίτλος:
Ανάλυση του υποκινητή του γονιδίου VPNB1 σε διαγονιδιακές σειρές Arabidopsis thaliana κατά την βλαστική και αναπαραγωγική φάση ανάπτυξης των φυτών’
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Ανάλυση του υποκινητή του γονιδίου VPNB1σε διαγονιδιακές σειρές Arabidopsis thaliana κατά την βλαστική και αναπαραγωγική φάση ανάπτυξης των φυτών’
Περίληψη:
Στα φυτά, υπάρχουν εξειδικευμένες αλληλουχίες σύνδεσης μεταγραφικών παραγόντων, οι οποίες ρυθμίζουν την έκφραση γονιδίων που εμπλέκονται σε εξειδικευμένες αναπτυξιακές διεργασίες ή βιοτικές και αβιοτικές καταπονήσεις. Σε αυτήν την κατηγορία ανήκουν και οι αλληλουχίες SMRE και SNBE που εντοπίζονται σε ποικίλες θέσεις του υποκινητή του γονιδίου VPNB1 του φυτού Arabidopsis thaliana. Το γονίδιο VPNB1, εκφράζεται αποκλειστικά στο αγωγό σύστημα του φυτού και φαίνεται να συμμετέχει στην βιογένεση και διαφοροποίησή του, καθώς έχει βρεθεί ότι εκφράζεται στα κύτταρα του καμβίου, του φλοιώματος και του διαφοροποιούμενου ξυλώματος. Το τελευταίο στάδιο της διαφοροποίησης των ξυλωματικών κυττάρων είναι η διαδικασία της εναπόθεσης δευτερογενών τοιχωματικών παχύνσεων. Αυτή περιλαμβάνει ένα πολύπλοκο δίκτυο μεταγραφικών παραγόντων, οι οποίοι αναγνωρίζουν τα στοιχεία σύνδεσης SMRE και SNBE. Στην παρούσα μελέτη, έγινε ανάλυση του υποκινητή του γονιδίου VPNB1 με διαδοχικές απαλοιφές ρυθμιστικών στοιχείων (promoter deletion analysis). Για τον σκοπό αυτό, έγινε ποιοτική και ποσοτική μελέτη διαγονιδιακών σειρών -που έφεραν κατασκευές μεταγραφικής σύντηξης του υποκινητή VPNB1 με το γονίδιο αναφοράς GUS- με δοκιμασία χρώσης κατά GUS και φθορισμομετρία, αντίστοιχα. Επιπρόσθετα, μελετήθηκαν ορισμένες σειρές σε κυτταροκαλλιέργειες VISUAL (Vascular cell Induction culture Using Arabidopsis Leaves), ως προς την απόκριση διαφοροποίησης των μεσοφυλλικών κυττάρων σε τραχειακά στοιχεία. Τα αποτελέσματα των ποσοτικών πειραμάτων έδειξαν ότι υπάρχει στατιστικά σημαντική μείωση της ενεργότητας του υποκινητή όταν αφαιρείται 1 SNBE που βρίσκεται στη θέση -1422, 1 SMRE στη θέση -1247, 1 SNBE στη θέση -1146 και 1 SNBE στη θέση -1041 διαδοχικά, τόσο στα αρτίβλαστα 3 και 8 ημερών όσο και σε αναπαραγωγικούς ιστούς (άνθη). Επίσης, τα αποτελέσματα των ποιοτικών πειραμάτων για το SMRE και τα δύο SNBE στις θέσεις -1247, -1146 και -1041 αντίστοιχα επιβεβαίωσαν τα ποσοτικά αποτελέσματα, καθώς η διαδοχική απαλοιφή τους επηρέαζε είτε την ένταση είτε την έκταση της χρώσης είτε και τα δύο. Τέλος, το πρωτόκολλο VISUAL οδήγησε σε επαγωγή της έκφρασης του γονιδίου VPNB1 σε όλες τις επιλεγμένες σειρές. Τα παραπάνω αποτελέσματα υποδεικνύουν ότι τα δύο υπό μελέτη ρυθμιστικά στοιχεία SMRE και SNBE δρουν συνεργιστικά στην επαγωγή του υποκινητή και την έκφραση του γονιδίου VPNB1 κατά τη διάρκεια ανάπτυξης και διαφοροποίησης του αγωγού συστήματος του φυτού A. thaliana και ότι η παρουσία τους είναι απαραίτητη για τη διαφοροποίηση των μεσσοφυλλικών κυττάρων σε τραχειακά στοιχεία.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
διαδοχικές απαλοιφές υποκινητή, Arabidopsis thaliana, ανάπτυξη αγωγού συστήματος, δοκιμασία GUS, VISUAL
Ευρετήριο:
Ναι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
2
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
69
Αριθμός σελίδων:
64
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-11-09.

Διπλωματική Θεοδώρου Μαρία.pdf
1 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-11-09.