Διερεύνηση μηχανισμών δράσης των παραγόντων STAT3 και STAT5 με μεθοδολογίες OMICS

Διπλωματική Εργασία uoadl:2967337 136 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Κατεύθυνση Βιοπληροφορική-Υπολογιστική Βιολογία
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2021-11-25
Έτος εκπόνησης:
2021
Συγγραφέας:
Μακρή Χαρίκλεια
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Βασιλική Α. Οικονομίδου, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια Βιοφυσικής - Μοριακής Βιοφυσικής, Τμήμα Βιολογίας,
Τομέας Βιολογίας Κυττάρου και Βιοφυσικής, ΕΚΠΑ
Ιωάννης Π. Τρουγκάκος, Καθηγητής Βιολογίας Ζωικού Κυττάρου και
Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας
Τομέας Βιολογίας Κυττάρου και Βιοφυσικής, Τμήμα Βιολογίας, ΕΚΠΑ
Ελένη Κατσαντώνη, Ερευνήτρια Γ’, (Επιστημονική Υπεύθυνη)
Τομέας Βασικής Έρευνας, Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών της Ακαδημίας
Αθηνώ
Πρωτότυπος Τίτλος:
Διερεύνηση μηχανισμών δράσης των παραγόντων STAT3 και STAT5 με μεθοδολογίες OMICS
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Διερεύνηση μηχανισμών δράσης των παραγόντων STAT3 και STAT5 με μεθοδολογίες OMICS
Περίληψη:
Οι παράγοντες STAT κατέχουν σημαντικό ρόλο τόσο σε φυσιολογικές κυτταρικές λειτουργίες, όσο και σε ασθένειες, συμπεριλαμβανομένων των συμπαγών και των αιματολογικών κακοηθειών. Μεταξύ των μελών της οικογένειας, οι STAT3 και STAT5 εμπλέκονται σε λευχαιμίες και αποτελούν θεραπευτικούς στόχους μεγάλου ενδιαφέροντος.
Με στόχο τη διερεύνηση του ρόλου των STAT5 και STAT3 στην ΟΜΛ, στην παρούσα Διπλωματική Εργασία πραγματοποιήθηκε βιοπληροφορική ανάλυση δεδομένων RNA-seq του Εργαστηρίου, από κύτταρα της σειράς MOLM-13 (κυτταρική σειρά ΟΜΛ) στα οποία είχε πραγματοποιηθεί μείωση της έκφρασης (KD) του STAT5A ή του STAT5B, μέσω shRNAs. Προσδιορίστηκαν διαφορικώς εκφραζόμενα γονίδια στις περιπτώσεις των KDs. Στην περίπτωση του STAT5B προσδιορίστηκαν και τα βιολογικά μονοπάτια που μεταβάλλονται στα ΟΜΛ κύτταρα, για την κατανόηση του μηχανισμού μέσω του οποίου ο STAT5B συμμετέχει στην παθοβιολογία της ΟΜΛ. Τέλος, δημιουργήθηκαν KDs του STAT3 στις κυτταρικές σειρές MOLM-13 και Kasumi-1 (κυτταρικές σειρές ΟΜΛ), τα οποία ελέγχθηκαν με RT-qPCR και Western Blot, προκειμένου να πραγματοποιηθούν μελλοντικά πειράματα RNA-seq και βιοπληροφορικές αναλύσεις.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
οξεία μυελογενής λευχαιμία, μεταγωγείς σήματος και ενεργοποιητές της μεταγραφής, ανάλυση διαφορικής έκφρασης
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
59
Αριθμός σελίδων:
76
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-11-26.

Διπλωματική_Εργασία_Μακρή.pdf
2 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο έως 2024-11-26.