Η μετα-μεταγραφική επεξεργασία του RNA στη ρευματοειδή αρθρίτιδα

Διδακτορική Διατριβή uoadl:2924367 152 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Τμήμα Ιατρικής
Βιβλιοθήκη Επιστημών Υγείας
Ημερομηνία κατάθεσης:
2020-10-15
Έτος εκπόνησης:
2020
Συγγραφέας:
Βλαχόγιαννης Νικόλαος
Στοιχεία επταμελούς επιτροπής:
Κουτσιλιέρης Μιχαήλ, Καθηγητής, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ
Σφηκάκης Πέτρος, Καθηγητής, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ
Κόλλιας Γεώργιος, Καθηγητής, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ
Στέλλος Κωνσταντίνος, Καθηγητής, Faculty of Medical Sciences, Newcastle University, UK
Σταματελόπουλος Κίμων, Αναπληρωτής Καθηγητής, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ
Τεκτονίδου Μαρία, Αναπληρώτρια Καθηγήτρια, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ
Σουλιώτης Βασίλειος, Διευθυντής Ερευνών, Ινστιτούτο Χημικής Βιολογίας, Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών
Πρωτότυπος Τίτλος:
Η μετα-μεταγραφική επεξεργασία του RNA στη ρευματοειδή αρθρίτιδα
Γλώσσες διατριβής:
Αγγλικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Η μετα-μεταγραφική επεξεργασία του RNA στη ρευματοειδή αρθρίτιδα
Περίληψη:
Η μετα-μεταγραφική επεξεργασία του RNA (RNA editing), με πιο συχνή μορφή τη μετατροπή της αδενοσίνης σε ινοσίνη (adenosine-to-inosine RNA editing), είναι μια βασική βιολογική διεργασία η οποία λαμβάνει χώρα κυρίως στις Alu περιοχές του μεταγραφώματος και διαμεσολαβείται από τα ένζυμα ADAR1 και ADAR2. Το ADAR1 έχει 2 ισομορφές, μια πιο μακριά (ADAR1p150) και μια βραχεία (ADAR1p110). Η σημασία του μηχανισμού αυτού τονίζεται από τον ενδομήτριο θάνατο των ποντικιών τα οποία στερούνται της ενζυματικής δράσης του ADAR1. Στην παρούσα μελέτη εξετάσαμε τη συμμετοχή του RNA editing στη Ρευματοειδή Αρθρίτιδα (ΡΑ), μια χρόνια φλεγμονώδη (αυτοάνοση) νόσο που επηρεάζει περίπου το 1% του πληθυσμού. Πιο συγκεκριμένα εξετάσαμε το ρόλο του RNA editing στη ρύθμιση των επιπέδων φλεγμονωδών μορίων. Για το σκοπό αυτό αναλύσαμε ένα RNA sequencing dataset που περιλάμβανε συνολικά 202 βιοψίες αρθρικού υμένα [28 υγιείς, 22 ασθενείς με οστεοαρθρίτιδα, 57 ασθενείς με πρώιμη ΡΑ (διάρκεια νόσου<1 έτος) και 95 ασθενείς με εγκατεστημένη ΡΑ]. Επίσης, συλλέξαμε αίμα από ασθενείς με ενεργό ΡΑ πριν- και 3 μήνες μετά την έναρξη νέας θεραπείας και απομονώσαμε λεμφομονοπύρηνα κύτταρα (PBMCs). Οι τεχνικές που χρησιμοποιήθηκαν ήταν ποσοτική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (qPCR) και Sanger sequencing. Τα αποτελέσματα της μελέτης ανέδειξαν σημαντική αύξηση της ισομορφής ADAR1p150 τόσο στον αρθρικό υμένα όσο και στο αίμα των ασθενών, ενώ τα επίπεδα της ισομορφής ADAR1p110 καθώς και του ενζύμου ADAR2 δε διέφεραν μεταξύ ασθενών και υγιών. Στη συνέχεια, εξετάσαμε το RNA editing της cathepsin S, ενός μορίου που εμπλέκεται ενεργά στην αντιγονοπαρουσίαση και στην διάσπαση εξωκυττάριας ουσίας και που έχει προταθεί ως σημαντικό κομμάτι της παθοφυσιολογίας της ΡΑ ή ακόμη και ως θεραπευτικός στόχος. Παρατηρήσαμε ότι το RNA editing στο στοιχείο AluSx+ της cathepsin S ήταν σημαντικά αυξημένο στα λεμφομονοπύρηνα κύτταρα ασθενών με ενεργό ΡΑ. Με ιδιαίτερο ενδιαφέρον παρατηρήσαμε πως τόσο η έκφραση του μορίου ADAR1p150 όσο και το RNA editing του AluSx+ της cathepsin S μειώθηκαν σημαντικά μετά τη θεραπεία στους ασθενείς που είχαν καλή ανταπόκριση στη φαρμακευτική αγωγή (κριτήρια EULAR), ενώ παρέμειναν αμετάβλητα στους ασθενείς με μέτρια ή καθόλου ανταπόκριση. Τέλος, η έκφραση της cathepsin S, που ήταν αυξημένη τόσο στον αρθρικό υμένα όσο και στα λεμφομονοπύρηνα κύτταρα των ασθενών, συσχετιζόταν ισχυρά τόσο με το ADAR1p150 όσο και με τα επίπεδα του RNA editing. Συμπερασματικά, προτείνουμε πως το RNA editing μπορεί να δρα ως ένα επιπρόσθετο, μετα-μεταγραφικό επίπεδο ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης στη ΡΑ.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
Ρευματοειδής αρθρίτιδα, ADAR1, Επεξεργασία του RNA, Στοιχεία Alu, Καθεψίνη S
Ευρετήριο:
Όχι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
223
Αριθμός σελίδων:
115
Vlachogiannis Nikolaos PhD.pdf (2 MB) Άνοιγμα σε νέο παράθυρο