Computer-Aided Drug Design for Discovery of Novel Adenosine A3 Receptor Antagonists - Investigation of the Orthosteric Binding Area and Functional Activity of the Antagonists

Διδακτορική Διατριβή uoadl:2928502 200 Αναγνώσεις

Μονάδα:
Τμήμα Φαρμακευτικής
Βιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2020-11-24
Έτος εκπόνησης:
2020
Συγγραφέας:
Λαγαρίας Παναγιώτης
Στοιχεία επταμελούς επιτροπής:
Antonios Kolocouris - Professor, Section of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, National and Kapodistrian University of Athens
Emmanuel Mikros - Professor, Section of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, National and Kapodistrian University of Athens
Andrew Tsotinis - Professor, Section of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, National and Kapodistrian University of Athens
Angeliki Kourounakis - Professor, Section of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, National and Kapodistrian University of Athens
Graham Ladds - Lecturer, Department of Pharmacology, University of Cambridge
Vassilis Myrianthopoulos - Assistant Professor, Section of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, National and Kapodistrian University of Athens
Thanassis Papakyriakou - Senior Researcher at the Institute of Biosciences and Applications, National Centre for Scientific Research “Demokritos”
Πρωτότυπος Τίτλος:
Computer-Aided Drug Design for Discovery of Novel Adenosine A3 Receptor Antagonists - Investigation of the Orthosteric Binding Area and Functional Activity of the Antagonists
Γλώσσες διατριβής:
Αγγλικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Υπολογιστικός σχεδιασμός φαρμάκων για καινοτόμους ανταγωνιστές του υποδοχέα Α3 της Αδενοσίνης - Έρευνα της ορθοστερικής περιοχής πρόσδεσης και λειτουργικής δράσης των Ανταγωνιστών
Περίληψη:
Επιδιώξαμε την εύρεση νέων φαρμακομορίων με στοχευμένη δράση έναντι των
υποτύπων Α2Α, Α1, Α2Β, Α3 που είναι πολύ σημαντική εξαιτίας της θεραπευτικης αξίας
των υποδοχέων. Αναστολείς των υποτύπων υποδοχεα της Αδενοσινης υπόσχονται πολλά,
όπως θεραπεία διαφόρων νεοπλασιών, νευροπαθειών κακής και δυσλειτουργικής δράσης του
ΚΝΣ. Πραγματοποιήθηκε α) εικονική σάρωση (Virtual Screening)
χημειοθήκης και βρέθηκαν συνολικά 23 από 25 δραστικες ενωσεις που δοκιμάστηκαν
κάποιες με εκλεκτικότητα στον υποδοχέα Α2 και β) πραγματοποιήθηκε ένας μεγάλος
αριθμός προσομοιωσεων MD σε υπερυπολογιστές λόγω της αδυναμίας των υπολογισμών
πρόσδεσης να περιγράψουν τις διαφορές στον τρόπο πρόσδεσης των ενώσεων στον ίδιο
ή διαφορετικούς υποδοχείς. Προέκυψαν 3 δημοσιεύσεις.
Πραγματοποιήθηκαν πρόσθετες MD για την ερμηνεία διαφορών του
τρόπου πρόσδεσης και αναγνώρισης των προσδετών με την περιοχή πρόσδεσης των υποδοχέων και έγινε υπολογισμός της ελεύθερης ενέργειας πρόσδεσης των χημικών μορίων με τους
υποδοχείς αδενοσίνης μέσω της τεχνικής MM-PBSA (Molecular Mechanics – Poisson-
Boltzmann Surface Area) με τη χρήση του λογισμικού AMBER14.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λοιπές θεματικές κατηγορίες:
Επιστήμες Υγείας
Λέξεις-κλειδιά:
Πρωτεΐνη G, Αδενοσίνη, Α1, Α2Α, Α3, Εικονική Σάρωση,Μοριακή Πρόσδεση, MM-PBSA, MMGBSA Μοριακή Δυναμική, Γενετικός Αλγόριθμος, Κ18
Ευρετήριο:
Ναι
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
12
Εικονογραφημένη:
Ναι
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
312
Αριθμός σελίδων:
205
Αρχείο:
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.

Lagarias_Thesis_FINAL.pdf
9 MB
Δεν επιτρέπεται η πρόσβαση στο αρχείο. H πρόσβαση επιτρέπεται μόνο εντός του δικτύου του ΕΚΠΑ.