Μονάδα:
Κατεύθυνση Κλινική Βιοχημεία - Μοριακή ΔιαγνωστικήΒιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2023-01-26
Συγγραφέας:
Παπαδοπούλου Αλεξάνδρα
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Αθηνά Μάρκου, Επίκουρη Καθηγήτρια, Τμήμα Χημείας, Ε.Κ.Π.Α.
Εύη Λιανίδου, Καθηγήτρια, Τμήμα Χημείας, Ε.Κ.Π.Α.
Μαργαρίτης Αυγέρης, Αναπληρωτής Καθηγητής, Τμήμα Ιατρικής, Ε.Κ.Π.Α.
Πρωτότυπος Τίτλος:
Μελέτη της επίδρασης του γενωμικού DNA στην ανίχνευση του HOTTIP σε δείγματα ασθενών με μεταστατικό καρκίνο του προστάτη
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Μελέτη της επίδρασης του γενωμικού DNA στην ανίχνευση του HOTTIP σε δείγματα ασθενών με μεταστατικό καρκίνο του προστάτη
Περίληψη:
Τα τελευταία χρόνια, ιδιαίτερο ενδιαφέρον έχει προσελκύσει η μέθοδος της υγρής
βιοψίας, ως μια εναλλακτική, μη επεμβατική προσέγγιση. Η υγρή βιοψία παρέχει τη
δυνατότητα ανίχνευσης γενετικών και επιγενετικών αλλαγών κατά την εξέλιξη της νόσου,
όπως και την παρακολούθηση των ασθενών, μέσω απλών επαναλαμβανόμενων
αιμοληψιών σε πραγματικό χρόνο. Κύριες πηγές της υγρής βιοψίας αποτελούν τα
κυκλοφορούντα καρκινικά κύτταρα, το εξωκυττάριο DNA, το εξωκυττάριο RNA, και τα
εξωκυτταρικά κυστίδια. Η ανάλυση του εξωκυττάριου RNA έχει κυρίως εστιαστεί στη
μελέτη των κυκλοφορούντων miRNAs και των μεγάλων μη κωδικών RNA (lncRNAs). Τα
lncRNAs έχει αποδειχτεί ότι παίζουν σημαντικό ρόλο στη γονιδιακή ρύθμιση σε
επιγενετικό, μεταγραφικό αλλά και μετα-μεταγραφικό επίπεδο. Επίσης, εμπλέκονται στην
παθογένεση των όγκων δρώντας είτε ως ογκογονίδια είτε ως ογκοκατασταλτικά γονίδια.
Το HOTTIP είναι ένα πολύ καλά μελετημένο lncRNA που έχει βρεθεί ότι δρα ως
ογκογονίδιο σε αρκετούς τύπους καρκίνου συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του
προστάτη.
Στην παρούσα μελέτη αρχικά μελετήθηκε η επίδραση του γενωμικού DNA στην
έκφραση του HOTTIP. Αναπτύχθηκε ευαίσθητη και ειδική μέθοδος πραγματικού χρόνου
PCR για την ανίχνευση του HOTTIP και ακολούθως προσδιορίστηκε η έκφραση του
HOTTIP σε 41 ζεύγη δειγμάτων - εξωσώματα και κυκλοφορούντα καρκινικά κύτταρα -
από ασθενείς με μεταστατικό καρκίνο του προστάτη. Χρησιμοποιώντας τους εκκινητές
που αναγράφονται στην πλειοψηφία των δημοσιευμένων εργασιών, διαπιστώθηκε ότι τα
ποσοστά ανίχνευσης του HOTTIP ήταν ιδιαίτερα αυξημένα καθώς δεν είχε ληφθεί υπόψιν
τους η επίδραση του γενωμικού DNA. Με την αναπτυχθείσα μέθοδο ανιχνεύθηκε το
HOTTIP στο 9,75 % των υπό εξέταση CTCs και στο 2,43 % στα αντίστοιχα εξωσώματα.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
Υγρή βιοψία, Μεταστατικός καρκίνος του προστάτη, lncRNA, HOTTIP, γενωμικό DNA, CTCs
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
0
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
101
