Μονάδα:
Τμήμα ΒιολογίαςΒιβλιοθήκη Σχολής Θετικών Επιστημών
Ημερομηνία κατάθεσης:
2020-09-17
Συγγραφέας:
Μητροπούλου Χριστίνα-Αγγελική
Στοιχεία επιβλεπόντων καθηγητών:
Χρήστος Κοντός, Επίκουρος Καθηγητής, Τμήμα Βιολογίας, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών
Πρωτότυπος Τίτλος:
Μελέτη και επαγωγή της έκφρασης θραυσμάτων RNA του 3’ άκρου του tRNACysGCA (tRF-CysGCA) σε ανθρώπινες κυτταρικές σειρές
Γλώσσες εργασίας:
Ελληνικά
Μεταφρασμένος τίτλος:
Μελέτη και επαγωγή της έκφρασης θραυσμάτων RNA του 3’ άκρου του tRNACysGCA (tRF-CysGCA) σε ανθρώπινες κυτταρικές σειρές
Περίληψη:
Τα θραύσματα tRNA είναι μικρά μη κωδικά μόρια RNA που προέρχονται από ώριμα ή μη μόρια tRNA. Προκύπτουν από ειδική ενζυματική δράση και όχι τυχαία αποικοδόμηση των tRNAs, που εξαρτάται από το σημείο κοπής στο μητρικό μόριο. Τα ένζυμα και τα μονοπάτια βιογένεσης τους φαίνεται να ποικίλουν και δεν έχουν εξακριβωθεί πλήρως. Η αφθονία τους εντός των κυττάρων είναι ανάλογη του ιστού προέλευσης, αν και πρόσφατες έρευνες δείχνουν ότι μπορεί να σχετίζεται και με τη συγκέντρωση των μητρικών μορίων tRNA. Διακρίνονται σε δύο βασικές κατηγορίες τα tRNA halves ή αλλιώς tiRNAs, τα οποία έχουν μήκος 31-40 νουκλεοτιδίων και παίρνουν το όνομα τους από το άκρο του tRNA μορίου που περιλαμβάνουν στην αλληλουχία τους (5’-tiRNAs ή 3’-tiRNAs), και στα tRNA fragments ή αλλιώς tRFs, τα οποία έχουν μικρότερο μέγεθος και περισσότερες υποκατηγορίες, ανάλογα με το αν προέρχονται από ώριμα ή πρόδρομα μόρια tRNA, και αν περιλαμβάνουν το 5’ ή 3’ άκρο των tRNA μορίων.
Στην παρούσα διπλωματική εργασία έγινε προσπάθεια μελέτης και επαγωγής της έκφρασης θραυσμάτων RNA του 3’ – άκρου του tRNACysGCA (tRFCysGCA) σε ανθρώπινες κυτταρικές σειρές. Στόχος της εργασίας, ήταν η επαγωγή της έκφρασης του 3’ tRFCysGCA μέσω μιας σειράς πειραμάτων που περιελάμβαναν τη βελτιστοποίηση της αντίδρασης αντίστροφης μεταγραφής ώστε να επιτυγχάνεται η αποδιάταξη μόνο των θραυσμάτων tRNA και όχι των μητρικών μορίων, κλωνοποίηση του γονιδίου του tRNACysGCA σε δύο διαδοχικούς πλασμιδιακούς φορείς για αύξηση της επιτυχίας της αντίδρασης, και τέλος την παροδική διαμόλυνση ευκαρυωτικών καρκινικών κυττάρων με τον ανασυνδυασμένο πλασμιδιακό φορέα που κατασκευάστηκε.
Με βάση τα αποτελέσματα που προέκυψαν φάνηκε ότι η πειραματική διαδικασία που
ακολουθήθηκε δεν οδήγησε σε στατιστικά σημαντική αύξηση των επιπέδων του tRF στα
διαμολυμένα κύτταρα. Παρ’ όλα αυτά ήταν μια πρώτη προσέγγιση του θέματος η οποία
επιδέχεται αρκετών τροποποιήσεων και βελτιστοποιήσεων. Επιπλέον με αφορμή τη
συγκεκριμένη εργασία, μπορούν να γίνουν επιπλέον πειράματα που θα σχετίζονται με την περαιτέρω μελέτη των μορίων αυτών, καθώς και των αλληλεπιδράσεων τους με μόρια στόχους τόσο σε φυσιολογικά κύτταρα, όσο και σε κύτταρα που βρίσκονται σε συνθήκες στρες ή σε παθολογικές συνθήκες.
Κύρια θεματική κατηγορία:
Θετικές Επιστήμες
Λέξεις-κλειδιά:
μεταφορικά RNA, θραύσματα tRNA, tRNAs, tRFs, tRNACys, tRNA halves, tiRNAs
Αρ. σελίδων ευρετηρίου:
2
Αρ. βιβλιογραφικών αναφορών:
73
